Il Dipartimento è responsabile di tre corsi di laurea magistrale:
- Corso di Laurea Magistrale in Scienze Chimiche
- Corso di Laurea Magistrale in Chimica Industriale
- Corso di laurea Magistrale in Scienza e Ingegneria dei Materiali
Inoltre, i docenti del Dipartimento svolgono lezioni ed esercitazioni anche per i seguenti corsi di laurea magistrale:
- Corso di laurea Magistrale in Metodologie per la Conservazione e il Restauro dei Beni Culturali (Dipartimento associato)
- Corso di laurea Magistrale in Biologia Applicata e Sperimentale
- Corso di laurea Magistrale in Biologia ed Ecologia Marina
- Corso di laurea Magistrale in Medical-Pharmaceutical Biotechnologies
- Corso di laurea Magistrale in Ingegneria Chimica e di Processo
Il Dipartimento partecipa al master internazionale in collaborazione con le università di Porto, Parigi Sud e Poznan:
Erasmus Mundus Master Course - Surface, Electro, Radiation and Photo-Chemistry (SERP_Chem)